Przewlekłe zapalenie przełyku z reguły rozwija się z ostrego zapalenia przełyku i opiera się praktycznie na tych samych czynnikach etiologicznych. Charakteryzuje się powstawaniem niegojących się owrzodzeń, występowaniem długotrwałych procesów zapalnych z jego bliznowaciejącym zwężeniem, guzami. Przewlekłe zapalenie przełyku może być zarówno nieswoiste, jak i swoiste (gruźlica, kiła, promienica).