Okres inkubacji zapalenia wątroby typu B trwa 60-180 dni, najczęściej 2-4 miesiące, w rzadkich przypadkach jest skracany do 30-45 dni lub wydłużany do 225 dni. Czas trwania okresu inkubacji zależy od dawki zakaźnej i wieku dzieci. W przypadku masywnego zakażenia (transfuzje krwi lub osocza) okres inkubacji jest krótki - 1,5-2 miesiące, a w przypadku manipulacji pozajelitowych (iniekcje podskórne i domięśniowe), a zwłaszcza w przypadku zakażenia domowego, czas trwania okresu inkubacji wynosi 4-6 miesięcy.