Pacjenci są zaniepokojeni następującymi objawami kleszczowego zapalenia mózgu: ból głowy, ogólne osłabienie, złe samopoczucie, dreszcze, uczucie gorąca, pocenie się, zawroty głowy, ból gałek ocznych i światłowstręt, utrata apetytu, ból mięśni, kości, kręgosłupa, kończyn górnych i dolnych, dolnej części pleców, szyi i stawów.